α螺旋的计算(螺旋的计算公式)

本篇文章给大家谈谈α螺旋的计算,以及螺旋的计算公式对应的知识点,希望对各位有所帮助,不要忘了收藏本站喔。

本文目录一览:

α螺旋完全伸展的长度怎么求

首先α螺旋每隔6个残基,螺旋上升一圈,用氨基酸个数/6得到螺旋数。其次螺距为0.54nm,螺旋数乘螺距0.54nm。最后得到α螺旋完全伸展的长度。

α-螺旋的结构要点:①肽链以螺旋状盘卷前进,每圈螺旋由6个氨基酸构成,螺圈间距(螺距)为44埃;②螺旋结构被规则排布的氢键所稳定,氢键排布的方式是:每个氨基酸残基的N—H与其氨基侧相间三个氨基酸残基的C=O形成氢键。这样构成的由一个氢键闭合的环,包含13个原子。

每6个氨基酸残基绕一圈,每圈0.54nm高,残基高度0.15nm,螺旋半径0.23nm;α螺旋结构的稳定主要靠链内的氢键。氢键形成于第n个氨基酸残基的羰基与线性顺序中第(n+4)个氨基酸残基的氨基之间。

在蛋白质的α-螺旋构象中,每隔6个氨基酸残基螺旋上升一圈,相当于向上平移4埃。螺旋的直径是11埃。螺旋上升时,每个氨基酸残基沿轴旋转100°,向上平移5埃,比完全伸展的构象压缩4倍。其二面角Φ=-57度,Ψ=-48度。

如:一条肽链的氨基酸序列中存在多聚丙氨酸,在pH7的水溶液中能自发形成α螺旋结构,因为Ala的R基小且不带电荷。 一条肽链的氨基酸序列中存在多聚异亮氨酸不能形成α螺旋,因为Ile的α-碳原子附近有较大的R基,造成空间位阻。

发现PrPC α-螺旋高达42%,β-片层(β-sheet)仅3%,而PrPSC的蛋白骨架却完全伸展,形成的β-片层高达43%,α螺旋仅30%〔5〕。 在培养细胞内,PrPC向PrPSC的转变发生在神经元内部,此后PrPSC在溶酶体中沉积。在大脑中填满PrPSC及伴随的杆状淀粉样(amyloid)颗粒的溶酶体,会突然爆破并损害细胞。

怎么用peakfit/omnic软件来计算蛋白质的二级结构中的α-螺

1、为了计算蛋白质二级结构中的α-螺旋含量,可以采用循环二色谱(CD)或傅里叶变换红外光谱(FTIR)技术收集数据。在CD谱图上,寻找α-螺旋对应的190-200 nm波长区域的峰进行峰拟合和积分。使用PeakFit或OMNIC软件进行操作,选择高斯或洛伦兹模型拟合峰,并计算峰面积。

α螺旋的计算的介绍就聊到这里吧,感谢你花时间阅-本站内容,更多关于螺旋的计算公式、α螺旋的计算的信息别忘了在本站进行查找喔。

本站内容来自用户投稿,如果侵犯了您的权利,请与我们联系删除。联系邮箱:835971066@qq.com

本文链接:http://www.316lbuxiugang.com/post/4478.html

友情链接: